Dựa trên tiểu thuyết Thần Y Cửu Tiểu Thư của Đậu Miêu Miêu, phim hoạt hình kể về Quân Cửu – thần y xinh đẹp thời hiện đại, mất mạng trong buổi đấu giá thuốc, xuyên không về cổ đại, nhập vào Cửu tiểu thư vô dụng. Là đích nữ Quân gia – một trong hai thế gia lớn hoàng thành – cô mồ côi cha mẹ, bị đày đến nhánh phụ ở thành La Phong, chịu đủ tủi nhục cho đến chết. Quân Cửu thừa hưởng ký ức, thề rửa nhục. Nhưng Cửu tiểu thư không hấp thụ được linh khí, trong khi tu tiên giới chỉ trọng võ lực. Dùng y thuật siêu phàm, Quân Cửu tẩy gân cốt, nâng thiên phú, kết giao bạn bè, dọn đường tương lai. Trong hành trình trả thù, cô gặp Mặc Vô Việt – người đàn ông lạnh lùng, gian xảo, bá đạo, tài năng xuất chúng. Dù người đời xem cô vô dụng, hắn nhận ra điều đặc biệt, âm thầm bảo vệ như tấm khiên vững chắc. Quân Cửu còn kết bạn với Vân Kiều, Cốc Tùng, Quân Tiểu Lôi, nhờ họ mà từng bước giành lại quyền lực Quân gia, diệt gian thần, phản loạn. Để tránh nhục khi bị thái tử hủy hôn, cô chủ động hủy trong tiệc thọ gia chủ, làm mọi người sững sờ. Sau đó, cô vào Thiên Tung Viện – học viện tu luyện đỉnh cao nước Thiên Tung – và nổi danh sau một trận chiến. Phim thuộc thể loại huyền huyễn, mạo hiểm, đầy kích thích và nhiệt huyết. Quân Cửu dùng y thuật cứu người, nỗ lực tu luyện trong thế giới cá lớn nuốt cá bé. Cô thông minh, kiên cường, gian xảo, không run sợ trước kẻ thù. Đối tốt với mọi người nhưng không mềm yếu, ra tay tàn nhẫn với kẻ xấu, hết lòng vì bạn bè. Khác phim huyền huyễn chỉ toàn đánh giết, phim này mang đến thế giới đầy nhân ái và lửa nhiệt.